分子医药与代谢工程团队

发布人：学院发布时间：2025-02-21 点击：

一、团队名称

分子医药与代谢工程团队

二、团队组成

目前团队共有教授1人，副教授2人，讲师3人。

三、团队介绍

团队固定研究人员6名，其中教授1人、副教授2人、讲师3人，分别毕业于北京大学、中国科学院、暨南大学、华中农业大学等知名研究机构，获多项省级人才项目支持。研究工作覆盖生物、医药、计算机、化学等学科交叉领域。迄今团队承担了各类科研项目30余项，其中国家自然科学基金项目8项，近三年研究经费近500万元，共发表SCI文章100余篇，授权发明专利20余项，获省部级奖2项。

团队主要研究内容包括（1）蛋白质设计和相互作用网络的调控；（2）药物筛选、优化和设计；（3）计算生物学与生物医学信息学分析；（4）重要代谢通路的调控、改造和设计。

四、科研成果

（1）代表性的科研项目：

1. 国家自然科学基金面上项目“多胺代谢网络ODC-OAZ1-AZIN1信号轴非均衡调控与乳腺癌异质性的相关性研究”；

2. 国家自然科学基金面上项目“鸟氨酸脱羧酶ODC二聚体稳定性抑制剂的发现与功能研究”；

3. 国家自然科学基金面上项目“调控tau蛋白液滴凝胶化转变的小分子筛选与构效关系研究”；

4. 国家自然科学基金重大计划培育项目“芽殖酵母细胞命运抉择网络的建模和分子调控机制研究”；

5. 国家自然科学基金青年项目“以蛋白质相互作用为核心的生物振荡器的研究与设计”；

6. 国家自然科学基金青年项目“天然无序蛋白质折叠与结合耦合机理的分子动力学模拟研究”；

7. 国家自然科学基金青年项目“天然无序蛋白质“序列—结构—功能” 关系的比较研究”；

8. 国家自然科学基金青年项目“多胺介导的细胞通讯对肿瘤相关巨噬细胞免疫抑制表型的作用研究”；

9. 湖北省自然科学基金创新群体项目“肿瘤细胞多胺代谢调控网络中关键蛋白的调控机理与干预研究”；

10. 湖北省自然科学基金杰出青年基金项目“针对多胺合成关键酶AdoMetDC的药物设计与多胺合成途径调控机制研究”

（2）代表性的成果获奖：

1. 2018年湖北省科技进步奖三等；

2. 2017年宜昌市优秀科研工作者；

3. 2016年湖北省自然科学优秀学术论文奖三等；

（3）代表性论文：

1. Nonnatural protein–protein interaction-pair design by key residues grafting. Sen Liu#, Shiyong Liu#, Xiaolei Zhu, Huanhuan Liang, Aoneng Cao, Zhijie Chang, Luhua Lai*.Proc. Natl. Acad Sci USA 2007, 104(13): 5330-5335.

2. Control of Protein Signaling Using a Computationally Designed GTPase/GEF Orthogonal Pair. Gregory T. Kapp#, Sen Liu#, Derek T. Wong, Attila Reményi, Brian Yeh, Jack Taunton, Wendell A. Lim, and Tanja Kortemme*.Proc. Natl. Acad Sci USA, 2012, 109(14):5277-5282.*** 封面推荐. ***期刊专评

3. Reliable cell cycle commitment in budding yeast is ensured by signal integration. Xili Liu#, Xin Wang#, Xiaojing Yang, Sen Liu, Lingli Jiang, Yimiao Qu, Lufeng Hu, Qi Ouyang, Chao Tang*.eLife2015, 4: e03977.

4. Discovery of covalent ligands via noncovalent docking by dissecting covalent docking based on a “steric-clashes alleviating receptor (SCAR)” strategy. Yuanbao Ai#, Lingling Yu#, Xiao Tan#, Xiaoying Chai, Sen Liu*.Journal of Chemical Information and Modeling, 2016, 56(8): 1563-1575. *** 封面论文

5. Cryptic sequence features within the disordered protein p27Kip1 regulate cell cycle signaling. Rahul K. Das#, Yongqi Huang#, Aaron H. Phillips#, Richard W. Kriwacki, Rohit V. Pappu*. Proc. Natl. Acad Sci USA, 2016, 133(20): 5616-5621.

6. The rational discovery of multipurpose inhibitors of the ornithine decarboxylase. Xiaoying Chai#, Jingqiong Zhan#, Jing Pan#, Mengxi He, Bo Li, Jing Wang, Hongyan Ma, Yanlin Wang, Sen Liu*.FASEB Journal, 2020, 34(9): 10907-10921.

7. Potential covalent drugs targeting the main protease of the SARS-CoV-2 coronavirus. Sen Liu#*, Qiang Zheng, Zhiying Wang. Bioinformatics, 2020, 36(11): 3295-3298.

8. Leveraging the multivalent p53 peptide-MdmX interaction to guide the improvement of small molecule inhibitors. Xiyao Cheng#, Rong Chen, Ting Zhou, Bailing Zhang, Zichun Li, Meng Gao, Yongqi Huang*, Huili Liu*, Zhengding Su*. Nature Communications, 2022, 13: 1087.

9. Obtaining protein foldability information from models of AlphaFold2 and RoseTTAFold. Sen Liu#*, Kan Wu, Cheng Chen. Computational and Structural Biotechnology Journal, 2022, 20: 4481-4489.

10. Methylene blue accelerates liquid-to-gel transition of tau condensates impacting tau function and pathology. Yongqi Huang#, Jitao Wen#, Lisa-Marie Ramirez, Eymen Gümüşdil, Pravin Pokhrel, Viet H Man, Haiqiong Ye, Yue Han, Yunfei Liu, Ping Li, Zhengding Su, Junmei Wang, Hanbin Mao, Markus Zweckstetter, Sarah Perrett, Si Wu, Meng Gao.Nature Communications, 2023, 14(1): 5444.

（4）代表性专利：

1. 来鲁华等，ZL200510086708.4; “具有促红细胞生长因子活性的蛋白质及其用途”。

2. 刘森等，ZL201410530672.3;一种S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶的活性检测方法及其应用。

3. 刘森等，ZL201410134532.4；肿瘤坏死因子-a转化酶的多肽抑制剂的筛选方法及其应用。

4. 刘森等，ZL201410530674.2；一种S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶的药物口袋及其应用。

5. 刘森等，ZL201410532418.7；小分子抑制剂及在抑制S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶上的应用。

6. 刘森等，ZL201410525202.8；一种小分子抑制剂及其在抑制鸟氨酸脱羧酶（ODC）上的应用。

7. 刘森，ZL201610257410.3；小分子共价抑制剂的计算机筛选方法及其在筛选S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶的共价抑制剂的应用。

五、研究生毕业去向

①攻读博士学位：推荐到中山大学、苏州大学等单位攻读博士学位。

②企事业单位：推荐到武汉协和医院、宜昌市中心人民医院等三甲医院、人福药业、武汉生物制品所等知名企业。

六、联系方式